La sequía y la pudrición de la corona y las raíces por Fusarium (FCRR) son tensiones importantes que afectan el crecimiento del trigo duro. Este estudio tuvo como objetivo evaluar la actividad antifúngica de las bacterias endófitas contra los patógenos de FCRR y su tolerancia a la sequía, así como evaluar sus efectos en el crecimiento del trigo bajo riego normal, estrés por sequía y pudrición de raíces inducida. Sesenta aislamientos bacterianos de plantas de trigo duro en Jordania fueron probados por su antagonismo contra y tolerancia a la sequía. Diez aislamientos fueron seleccionados en base a su actividad antagónica y tolerancia a la sequía para su posterior identificación molecular. Experimentos de invernadero mostraron que varios endófitos, incluyendo (aislado 52), (aislados 37 y 38), y (aislado 60), exhibieron una promoción significativa del crecimiento bajo condiciones normales y de estrés por sequía. El aislado 52 demostró una alta actividad antagónica y una muy alta tolerancia a la sequía, convirtiéndose en un candidato prometedor para el desarrollo de biocontrol y biofertilizantes. Además, los tratamientos bacterianos redujeron significativamente la severidad de FCRR, con reducciones de hasta un 82% en condiciones normales y hasta un 61% bajo estrés por sequía. Estos hallazgos sugieren que las bacterias endófitas pueden mejorar la resistencia del trigo duro tanto a la sequía como a las infecciones por Fusarium, ofreciendo una solución sostenible para mejorar la productividad del trigo en entornos propensos al estrés.