Objetivo: El presente estudio tuvo como objetivo evaluar la eficiencia de cuatro métodos de muestreo para la identificación y cuantificación aplicados en estudios sobre la biodiversidad y la distribución espacio-temporal del ficoperifiton en el estuario del río Ratones

Métodos: Los muestreos se realizaron en tres estaciones a lo largo del río Ratones en marzo y agosto de 2008. Las metodologías utilizadas para la separación del perifiton del sedimento se llevaron a cabo mediante el uso de tamices y tejidos de atrapamiento. Para los epífitos se empleó un método de remoción mediante agitación manual y análisis "in situ". Para evaluar la eficiencia de la metodología para perifiton, se incluyeron datos de fitoplancton con fines comparativos

Resultados: La opción del método de atrapamiento fue la más adecuada para remover los especímenes vivos del sedimento y minimizar los problemas encontrados con las otras dos metodologías probadas. En el caso de las microalgas epífitas, la mejor técnica de conteo resultó ser el método "in situ"

Conclusiones: En resumen, los resultados presentados respaldan las dificultades encontradas al estudiar muestras de ficoperifiton en estuarios, que son ambientes poco profundos y dinámicos, y por esa razón las comunidades presentes en estas áreas están constantemente influenciadas por el sedimento