Objetivo: Contribuir al conocimiento taxonómico de las Euglenophyceae pigmentadas en la llanura de inundación del Alto río Paraná mediante la ampliación del inventario de biodiversidad en este ecosistema, además de aportar al conocimiento sobre la distribución geográfica de este grupo en Brasil.

Métodos: Se realizaron muestreos trimestrales en la región limnética de un lago de llanura de inundación entre febrero de 2000 y marzo de 2009, obteniendo un total de 30 muestras mediante arrastres verticales y horizontales con red de plancton de 15 μm de abertura de malla y conservadas en solución de Transeau. Se prepararon láminas temporales para la identificación, medición y fotografía de los organismos mediante cámara digital acoplada a un microscopio óptico binocular Olympus con aumentos de 400x/1000x. El análisis incluyó el cálculo de la Constancia (C) para la muestra de cada especie.

Resultados: Se identificaron 36 taxones. El género Trachelomonas Ehr. emend. Defl. presentó la mejor representación, con 20 taxones. Entre los taxones registrados, el 53 % (19 taxones) constituyeron nuevos registros de ocurrencia para la llanura de inundación del Alto Paraná. Los taxones clasificados como frecuentes (33,3 %) son considerados cosmopolitas y presentan amplia distribución geográfica en Brasil; sin embargo, la mayoría de los taxones registrados (67 %) fue clasificada como esporádica o rara, lo cual probablemente se relaciona con la alta variabilidad ambiental observada a lo largo del período de estudio.

Conclusión: De los taxones registrados, 19 constituyeron nuevos registros de ocurrencia para la llanura de inundación del Alto Paraná y ampliaron la distribución geográfica de las Euglenophyceae en Brasil.