La red cerebral consta de diez mil millones de neuronas y es la estructura más compleja del universo. Comprender la estructura de las redes cerebrales complejas y las funciones neuronales es uno de los principales objetivos de la neurociencia moderna. Desde la invención seminal de la tinción de Golgi, los métodos de etiquetado de células individuales han sido uno de los enfoques más potentes para descomponer las estructuras neuronales y los circuitos neuronales. Además, el desarrollo de métodos transgénicos de células individuales escasas ha permitido estudios de eliminación de genes en células individuales para examinar las funciones locales de varios genes en circuitos neuronales y sinapsis. Aquí, revisamos los métodos de etiquetado de células individuales no transgénicos y los avances recientes en estrategias transgénicas para el etiquetado neuronal individual escaso. Estos métodos y estrategias contribuirán fundamentalmente a la comprensión de la estructura y función del cerebro.