Los estudios que correlacionan la estructura de una molécula con su función o actividad biológica son útiles para identificar los componentes estructurales que determinan cómo la molécula interactúa con las proteínas de unión. Esto permite la síntesis de análogos estructurales con propiedades deseables, como agroquímicos que mejoran los rasgos de desarrollo de las plantas o adaptaciones al estrés ambiental. Esta revisión destaca un grupo de pequeñas moléculas de señalización inductoras de defensa en plantas, caracterizadas por un esqueleto molecular derivado de ácidos grasos con diferentes grupos funcionales. Estos incluyen ácidos grasos 3-hidroxilados de cadena media (mc-3-OH-FAs) derivados de la pared celular bacteriana; volátiles de hojas verdes (GLVs), que comprenden aldehídos primarios, alcoholes y ésteres derivados de membranas vegetales; conjugados de ácidos grasos-aminoácidos (FACs) derivados de insectos, caeliferinas y bruchinas; y bases esfingolípidas de patógenos oomicetos. Estas moléculas son típicamente lipofílicas, y su mecanismo de acción probablemente está determinado tanto por características estructurales específicas como por propiedades fisicoquímicas. Activan respuestas de defensa a través de vías de señalización y, por lo tanto, se presume que interactúan con proteínas receptoras extracelulares o intracelulares. Sin embargo, los receptores clásicos solo se han caracterizado para mc-OH-FAs, bases esfingolípidas y FACs. Los estudios de estructura-función pueden revelar características estructurales de estas moléculas que son críticas para la unión a receptores y relevantes para la especificidad de estas interacciones. Esto es particularmente significativo para los GLVs, que han sido ampliamente investigados por sus roles en la señalización de estrés en plantas y la comunicación entre plantas, sin embargo, hasta la fecha no se ha identificado un receptor específico. Esta revisión comparativa tiene como objetivo arrojar luz sobre la percepción de los GLVs y otras pequeñas moléculas.