Estudios a Nivel Genómico de Miembros de la Familia en Soja () y Sus Respuestas ante Estrés Abiótico
Autores: Zhang, Zhenbiao; Zhang, Zhongqi; Shan, Muhammad; Amjad, Zarmeena; Xue, Jin; Zhang, Zenglin; Wang, Jie; Guo, Yongfeng
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Estudios a Nivel Genómico de Miembros de la Familia en Soja () y Sus Respuestas ante Estrés Abiótico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Forminas
Proteínas fh2
Soja
Familia de genes
Estrés abiótico
Interacción de proteínas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Las proteínas forminas o proteínas de homología formina 2 (FH2), proteínas multi-dominio evolutivamente conservadas en eucariotas, sirven como organizadores clave de actina, orquestando la estructura y dinámica del citoesqueleto de actina. Sin embargo, una investigación exhaustiva sobre la familia de forminas y su posible participación en el estrés abiótico sigue sin documentarse en la soja. En el estudio actual, se discernieron 34 miembros de la familia de soja, cuya distribución genómica abarca los veinte cromosomas en un patrón no uniforme. El análisis evolutivo de la familia de genes a través de especies vegetales delineó cinco grupos discernibles (Grupo I a V) y mostró una relación evolutiva más cercana dentro de , , y . El análisis de la estructura del gen reveló longitudes de secuencia variables y una diversidad sustancial en motivos conservados. La predicción estructural en las regiones promotoras del gen sugirió un gran conjunto de elementos cis-actuantes asociados con la señalización hormonal, el crecimiento y desarrollo de las plantas, y las respuestas al estrés. La investigación de la relación sinténica reveló una mayor convergencia de genes con dicotiledóneas, indicando una afinidad evolutiva cercana. Los datos del transcriptoma revelaron patrones de expresión distintivos de varios genes en diversos tejidos vegetales y etapas de desarrollo, subrayando un marco regulatorio espaciotemporal que rige la dinámica transcripcional del gen. El análisis de expresión génica y qRT-PCR identificó muchos genes con un patrón dinámico en respuesta a estrés abiótico, revelando sus posibles roles en la regulación de la adaptación al estrés en las plantas. Además, el análisis de interacción proteica destacó una intrincada red de interacciones entre diversas proteínas GmFH. Estos hallazgos subrayan colectivamente una nueva función biológica de las proteínas GmFH en facilitar la adaptación al estrés en la soja.
Descripción
Las proteínas forminas o proteínas de homología formina 2 (FH2), proteínas multi-dominio evolutivamente conservadas en eucariotas, sirven como organizadores clave de actina, orquestando la estructura y dinámica del citoesqueleto de actina. Sin embargo, una investigación exhaustiva sobre la familia de forminas y su posible participación en el estrés abiótico sigue sin documentarse en la soja. En el estudio actual, se discernieron 34 miembros de la familia de soja, cuya distribución genómica abarca los veinte cromosomas en un patrón no uniforme. El análisis evolutivo de la familia de genes a través de especies vegetales delineó cinco grupos discernibles (Grupo I a V) y mostró una relación evolutiva más cercana dentro de , , y . El análisis de la estructura del gen reveló longitudes de secuencia variables y una diversidad sustancial en motivos conservados. La predicción estructural en las regiones promotoras del gen sugirió un gran conjunto de elementos cis-actuantes asociados con la señalización hormonal, el crecimiento y desarrollo de las plantas, y las respuestas al estrés. La investigación de la relación sinténica reveló una mayor convergencia de genes con dicotiledóneas, indicando una afinidad evolutiva cercana. Los datos del transcriptoma revelaron patrones de expresión distintivos de varios genes en diversos tejidos vegetales y etapas de desarrollo, subrayando un marco regulatorio espaciotemporal que rige la dinámica transcripcional del gen. El análisis de expresión génica y qRT-PCR identificó muchos genes con un patrón dinámico en respuesta a estrés abiótico, revelando sus posibles roles en la regulación de la adaptación al estrés en las plantas. Además, el análisis de interacción proteica destacó una intrincada red de interacciones entre diversas proteínas GmFH. Estos hallazgos subrayan colectivamente una nueva función biológica de las proteínas GmFH en facilitar la adaptación al estrés en la soja.