Las arañas se han utilizado cada vez más como indicadores ambientales y ecológicos en la conservación y gestión de ecosistemas. En los Neotrópicos, hay una escasez de información sobre las taxonomías de las arañas y sus respuestas ecológicas a las perturbaciones antropogénicas. Para desentrañar estos problemas, probamos la posibilidad de utilizar indicadores de alta diversidad y alta funcionalidad para evaluar la sensibilidad de los ensamblajes de arañas a los cambios en el paisaje. Este enfoque, si resulta informativo, podría superar las limitaciones relevantes de los índices derivados de la taxonomía, que se consideran que consumen mucho tiempo, son costosos y dependen de la disponibilidad de (pocos) taxónomos expertos. Nuestros resultados destacan la pertinencia de las respuestas de ambos indicadores a los cambios estructurales inducidos por el aumento de la perturbación antropogénica, y están asociados con reducciones en la complejidad del ecosistema, microclimas y microhábitats. En general, ambos indicadores fueron sensibles a los cambios estructurales inducidos por la perturbación antropogénica y deben considerarse un recurso útil para evaluar la magnitud de las interrupciones en los ecosistemas de los Neotrópicos, así como para guiar a los gestores en la restauración de paisajes.