La valorización de la variabilidad genética intravarietal a través de la identificación de los genotipos más adecuados para el rendimiento y la calidad del mosto es una estrategia adecuada para la selección de la vid. Actualmente, el cambio climático afecta el rendimiento de la vid y la calidad del vino de numerosas maneras, pero hay poca información disponible sobre la variabilidad intravarietal en relación con las respuestas a los estreses abióticos. En el trabajo actual, se estudió la variabilidad genética intravarietal de la variedad blanca portuguesa Arinto para el rendimiento, la calidad del mosto y la tolerancia al estrés abiótico, a través de mediciones indirectas, rápidas y no destructivas en el campo. Se describe un enfoque innovador en la selección para la tolerancia al estrés abiótico. Se midió la temperatura superficial de las hojas (SLT) de los clones bajo condiciones ambientales de sequía y calor extremo, así como el NDVI (Índice de Vegetación de Diferencia Normalizada); PRI (Índice de Reflectancia Fotocanica); y el contenido de clorofila a través del índice SPAD, el rendimiento y las características del mosto (pH, acidez y grados Brix). La aplicación de esta metodología se llevó a cabo en una población experimental de 165 clones de Arinto durante tres años. Se ajustaron modelos lineales mixtos a los datos de los rasgos evaluados, y se obtuvieron los mejores predictores lineales no sesgados empíricos (EBLUPs) de los efectos genotípicos, así como el coeficiente de variación genotípica (CVG) y la heredabilidad en sentido amplio. Los genotipos se clasificaron según su nivel de tolerancia al estrés abiótico sin pérdida de rendimiento/calidad. La SLT permitió la identificación de clones que regulan la apertura de los estomas durante el estrés, correlacionándose así positivamente con el rendimiento. La SLT parece, por lo tanto, ser el indicador más robusto y confiable para evaluar la tolerancia al estrés en grandes ensayos de campo para la selección de la vid. Los resultados permitieron la selección de un grupo de diez clones con mayor tolerancia al estrés, en comparación con el promedio de la variedad, que mantuvo la calidad típica del mosto de Arinto.