La cría de variedades de bajo cianuro de hidrógeno (HCN) es un objetivo principal de los programas que se centran en productos alimenticios de yuca hervida. Para mejorar la cría de variedades de bajo HCN, es esencial conocer la variación genética y la heredabilidad de los rasgos. En este estudio, se establecieron 64 clones de yuca en cuatro ubicaciones y se evaluaron para HCN utilizando tres métodos de evaluación de HCN: uno con una escala de 1 a 9, otro con una escala de 0 ppm a 800 ppm, y un ensayo cuantitativo basado en lecturas de espectrofotómetro (HCN_Spec). También se recopilaron datos sobre las variables climáticas de precipitación, humedad relativa y temperatura. Se observaron diferencias altamente significativas entre los clones (< 0.001) y las ubicaciones (< 0.001). También hubo interacciones significativas entre clones y el entorno, variando de < 0.05 a < 0.001. Las ubicaciones de Arua y Serere mostraron puntuaciones de HCN más altas entre los clones y se asociaron con temperaturas diarias medias significativamente más altas (< 0.001) y valores de humedad relativa más bajos (%) en intervalos de 12 h y 18 h. Dentro de las ubicaciones, las estimaciones de heredabilidad en sentido amplio de HCN variaron de 0.22 a 0.64, mientras que las estimaciones de heredabilidad combinada por ubicación variaron de 0.14 a 0.32. Las relaciones entre los métodos fueron positivas y fuertes (r = 0.75-0.92). La escala de 1 a 9 es más precisa y más reproducible que la escala de 0 a 800 ppm o los métodos espectrofotométricos. Se espera que la información aquí presentada acelere los esfuerzos hacia la cría de variedades de yuca de bajo HCN.