Este estudio exploratorio investiga los cambios en el sistema cardíaco autónomo de jóvenes astronautas análogos en un entorno hostil, confinado y aislado. Utiliza índices lineales y no lineales de variabilidad de la frecuencia cardíaca (VFC) durante una misión análoga a Marte para evaluar cómo varía la VFC bajo estresores diurnos y nocturnos. Este estudio se guía por la hipótesis de que ocurren cambios significativos en la VFC basados en los días de adaptación, con el objetivo de ofrecer información sobre la adaptación del sistema nervioso autónomo (SNA) a los estresores ambientales. Durante cinco días en agosto de 2022, cinco astronautas análogos enfrentaron condiciones adversas en el desierto de Mojave, simulando condiciones marcianas. Se registraron electrocardiogramas diariamente durante cinco minutos en sesiones matutinas y vespertinas para extraer series temporales cortas de RR. Los parámetros de VFC se analizaron utilizando índices tanto del dominio del tiempo como del dominio de la frecuencia y medidas no lineales. Las diferencias significativas en los parámetros de VFC a lo largo de los días destacan el impacto del entorno de la misión en la función cardíaca autónoma. Las mediciones matutinas mostraron cambios significativos en los intervalos promedio de RR y la frecuencia cardíaca, indicando adaptación del SNA. Los índices no lineales, como el análisis de fluctuación desfasada y la entropía aproximada, también mostraron diferencias significativas, reflejando cambios en la función autónoma. La escala de Borg indicó una reducción en la percepción del esfuerzo a lo largo del tiempo, alineándose con los cambios en la VFC. El aumento de la actividad vagal durante la adaptación análoga a Marte bajo confinamiento/aislamiento puede ser crucial para la adaptación cardiovascular y la supervivencia en futuros vuelos espaciales.