La temperatura óptima de crecimiento es necesaria para el máximo potencial de rendimiento en cualquier cultivo. La temperatura atmosférica global está cambiando de manera más rápida e irregular cada año. La alta temperatura en la etapa de floración/reproductiva en el arroz provoca esterilidad parcial a completa del polen, lo que resulta en una reducción significativa en el rendimiento de grano. El Arroz Súper Verde (GSR) es un esfuerzo para desarrollar un tipo de arroz de élite que pueda resistir múltiples tensiones ambientales y mantener el rendimiento en diferentes zonas agroecológicas. El estudio actual se realizó para evaluar el efecto del estrés por calor en los atributos agronómicos y fisiológicos de GSR en la etapa de floración. Veintidós líneas de GSR y cuatro controles locales fueron evaluados bajo condiciones normales y de estrés por calor para diferentes parámetros agrofisiológicos, incluyendo altura de la planta (PH), macollos por planta (TPP), rendimiento de grano por planta (GY), rendimiento de paja por planta (SY), índice de cosecha (HI), peso de 1000 granos (GW), longitud del grano (GL), estabilidad de la membrana celular (CMS), índice de vegetación diferencial normalizado (NDVI) y porcentaje de fertilidad del polen (PFP). Los genotipos mostraron variaciones significativas para todos los parámetros estudiados excepto NDVI. El análisis de asociación y de componentes principales (PCA) explicó la diversidad genética de los genotipos y la relación entre los parámetros particulares y el rendimiento de grano. Encontramos que GY, junto con otros rasgos agronómicos como TPP, SY, HI y CMS, fueron muy afectados por el estrés por calor en la mayoría de los genotipos, mientras que PH, GW, GL, PFP y NDVI solo se vieron afectados en algunos genotipos. Superando a NGSR-16 y NGSR-18 en estrés por calor podrían ser utilizados como progenitores para el desarrollo de arroz tolerante al calor. Además, estos hallazgos serán útiles en la prevención y manejo del estrés por calor en el arroz.