La estabilidad de los agregados del suelo es un factor importante que impacta en la restauración ecológica y la erosión del suelo. El carbono orgánico del suelo (SOC) también es un factor importante que afecta las características y la calidad del suelo. El sistema de cultivo triple tiene el potencial de mejorar la estabilidad de los agregados del suelo al promover una cobertura vegetal más diversa y continua, lo que podría conducir a una mejor estructura del suelo y resistencia a la erosión. Durante dos años consecutivos, este estudio se llevó a cabo para explorar los impactos del sistema de cultivo triple en la estabilidad de los agregados del suelo, el pool de carbono del suelo y las características de secuestro de carbono en el tramo medio del río Yangtsé. Se establecieron cinco modos de siembra en este estudio, a saber, veza-arroz temprano-arroz tardío (CRR, CK), veza-arroz temprano-batata||soja (CRI), colza-arroz temprano-arroz tardío (RRR), colza-arroz temprano-batata||soja (RRI) y papa-arroz temprano-arroz tardío (PRR). La contribución de los agregados del suelo > 2 mm bajo CRI aumentó un 20.77%, 6.71% y 2.19% en comparación con el control en los periodos de cultivo de invierno y cosecha temprana y tardía de arroz, respectivamente. Durante el periodo de cosecha de invierno, el diámetro medio geométrico (GMD) y el diámetro medio de peso (MWD) del tratamiento CRI fueron significativamente más altos que en otros tratamientos (< 0.05), con aumentos de 7.53-16.28% y 4.67-10.28% respectivamente. Después de la cosecha del arroz tardío, los valores de GMD de los tratamientos CRI y PRR fueron significativamente más altos que en el tratamiento de control en un 13.56%, y los valores de MWD fueron más altos que los de otros tratamientos en un 4.24-13.17%, 3.74-12.63% (< 0.05). Además, CRI también mejoró el GMD y MWD de los agregados del suelo, y la estabilidad de los agregados del suelo se mejoró con la veza de invierno (tratamiento de CRI) y los modelos de cultivo múltiple de arroz en secano (tratamiento de PRR). El tratamiento RRR fue beneficioso para la acumulación de carbono orgánico del suelo y ralentizó la pérdida de carbono orgánico del suelo. El riego y el cultivo múltiple en épocas de sequía pueden aumentar eficazmente el contenido de carbono orgánico activo del suelo, entre los cuales el tratamiento de CRI tuvo el mejor rendimiento y el efecto más significativo en aumentar el contenido de carbono orgánico activo del suelo. Después de la cosecha del arroz tardío, el contenido de carbono orgánico activo del suelo en el tratamiento de CRI fue el más alto, lo cual fue significativamente diferente al tratamiento de control y aumentó un 35.62% en comparación con el control (< 0.05). En comparación con antes de la siembra, el contenido de carbono de la biomasa microbiana del suelo en cada tratamiento aumentó un 12.07-27.59% después de la cosecha del arroz tardío. El contenido de carbono orgánico disuelto en el suelo en el tratamiento de CRI fue el más alto, lo cual fue significativamente mayor que en el tratamiento CK, RRR y PRR, con un aumento del 46.88%, 42.42% y 30.56% respectivamente (< 0.05). Además, la acumulación de carbono de la biomasa microbiana del suelo, el contenido de carbono orgánico disuelto en el suelo y el contenido de carbono orgánico fácilmente oxidable del suelo fue promovida por el cultivo múltiple en campos de arroz, y el aumento del tratamiento de CRI y RRI fue más significativo. En conclusión, en el área de cultivo triple de campos de arroz en el tramo medio del río Yangts