En muchos países, los gobiernos apoyan el desarrollo de la agricultura local a través de subsidios. Subsidiar las ventas de productos agrícolas a través de canales de comercio electrónico es una forma de apoyar el desarrollo de la agricultura en China. Este estudio tiene como objetivo desarrollar un modelo de beneficios y aplicar la teoría de juegos de Stackelberg para determinar qué tipo de subsidios y toma de decisiones pueden proporcionar los máximos beneficios para las cadenas de suministro de productos agrícolas de comercio electrónico. Los resultados indican que tanto para decisiones centralizadas como descentralizadas, subsidiar a la cooperativa agrícola es mejor que subsidiar a los consumidores y no subsidiar. El volumen de ventas, el nivel de conservación, los esfuerzos de ventas y el beneficio general de la cadena de suministro de productos agrícolas de comercio electrónico son significativamente mayores. Se sugiere que el gobierno debería desempeñar un papel principal para apoyar el desarrollo de productos agrícolas de comercio electrónico. Este estudio contribuye a la investigación agrícola al desarrollar un modelo de beneficios para examinar los efectos de diferentes estrategias de subsidio gubernamental en cada miembro de la cadena de suministro de compras en línea agrícola. Se proporcionan recomendaciones para cooperativas agrícolas, plataformas de comercio electrónico y el gobierno para mejorar la calidad y las ventas de productos agrícolas a través de canales de compras en línea.