Menos estudios sobre la seguridad ecológica (SE) en áreas fronterizas limitan el desarrollo sinérgico de estas zonas en el contexto de la rápida globalización. El estudio de la SE en las áreas fronterizas del suroeste de China puede enriquecer los métodos de evaluación, resumir el conocimiento relacionado con la SE en estas zonas y proporcionar referencias para áreas similares en el mundo. Por lo tanto, se seleccionaron veinticinco condados fronterizos internacionales en la provincia de Yunnan para establecer un sistema de evaluación de la SE; se utilizó un modelo TOPSIS con peso de entropía para evaluar los cambios en la SE desde 2004 hasta 2019. Luego, se utilizó un modelo de grado de obstáculo para diagnosticar los factores que afectan la SE. El estado de la SE se predijo mediante un modelo de predicción gris (GM) (1,1) para 2025 y 2030. Los resultados muestran que una situación de SE en mejora presentó un patrón de distribución espacial de alto a bajo desde el suroeste hacia el oeste y el este. Varios factores, incluidos la inversión en activos fijos, los ingresos fiscales per cápita, el PIB per cápita, la producción de alimentos y la regulación del agua, crearon obstáculos para una SE deseable en el área de estudio. Aunque la SE de las áreas fronterizas mantendrá una tendencia ascendente bajo el modelo de desarrollo existente, se predice que el número de condados que alcanzará un estado seguro de SE en 2025 y 2030 será de solo 1 y 2, respectivamente.