Los tamarinos son un grupo distinto de monos del Nuevo Mundo de tamaño pequeño con relaciones filogenéticas complejas y rasgos citogenéticos poco estudiados. En este estudio, aplicamos análisis citogenéticos moleculares mediante hibridación in situ por fluorescencia con sondas específicas para secuencias teloméricas y loci de ADN ribosómico después de la tinción con DAPI/CMA3 en metafases de cinco especies de tamarinos, a saber, con el objetivo de investigar la distribución de secuencias repetitivas y su posible papel en la evolución del genoma. Nuestros análisis revelaron que las cinco especies examinadas muestran cariotipos similares, 2n = 46, que difieren principalmente en la morfología de los pares de cromosomas 16-17 y 19-22, debido a la diversa distribución de loci de rDNA, la amplificación de secuencias similares a telómeros, la presencia de bloques heterocromáticos y/o posibles reorganizaciones cromosómicas, como inversiones. Se discuten las diferencias en los rasgos citogenéticos entre especies de tamarinos en un marco filogenético comparativo, y además de los datos de estudios anteriores, subrayamos sinapomorfías y apomorfismos que aparecieron durante la diversificación de este grupo de monos del Nuevo Mundo.