Desentrañando los impactos alélicos en la resistencia a la germinación previa a la cosecha en -B de accesiones de trigo chino utilizando el pan-genoma
Autores: Wang, Danfeng; Xie, Jinjin; Wang, Jingwen; Mu, Mengdi; Xiong, Haifeng; Ma, Fengshuo; Li, Peizhen; Jia, Menghan; Li, Shuangjing; Li, Jiaxin; Zhu, Mingyue; Li, Peiwen; Guan, Haiyan; Zhang, Yi; Li, Hao
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Desentrañando los impactos alélicos en la resistencia a la germinación previa a la cosecha en -B de accesiones de trigo chino utilizando el pan-genoma
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Gen
Trigo
Resistencia
Haplotipos
SNPs
PHS
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
El gen, ubicado en el cromosoma 3B del trigo, es un homólogo del gen () del maíz y se informó que confiere resistencia a la germinación previa a la cosecha (PHS) en trigo. En este estudio, se analizó la estructura del gen utilizando el pan-genoma de trigo que consiste en 20 cultivares liberados (19 de trigo son de China), y se identificaron 3 polimorfismos de nucleótido simple (SNPs) en las posiciones 496 bp, 524 bp y 1548 bp de la región CDS, respectivamente. El análisis de haplotipos mostró que estos SNPs estaban en completo desequilibrio de ligamiento y que solo estaban presentes dos haplotipos designados como hap1 (TGG) y hap2 (GAA). El análisis de asociación entre haplotipos y resistencia a PHS de los 20 cultivares de trigo en cuatro entornos experimentales reveló que la resistencia promedio a PHS de los accesos con hap1 fue significativamente mejor que la de los accesos con hap2, lo que infiere los efectos sobre la resistencia a PHS en trigo. Para investigar más a fondo los impactos de los alelos en el locus sobre la resistencia a PHS, el SNP en 1548 bp de la región CDS se convirtió en un marcador KASP, que se utilizó para genotipar 304 cultivares de trigo chinos, cuya resistencia a PHS se evaluó en tres entornos. Las tasas promedio de germinación (SRs) de 135 cultivares de trigo con hap1 fueron significativamente más bajas que las de 169 cultivares con hap2, validando los impactos sobre la resistencia a PHS en el trigo chino. El presente estudio proporcionó el marcador amigable para la cría de variantes funcionales en el gen, que puede ser utilizado para la mejora genética de la resistencia a PHS en trigo.
Descripción
El gen, ubicado en el cromosoma 3B del trigo, es un homólogo del gen () del maíz y se informó que confiere resistencia a la germinación previa a la cosecha (PHS) en trigo. En este estudio, se analizó la estructura del gen utilizando el pan-genoma de trigo que consiste en 20 cultivares liberados (19 de trigo son de China), y se identificaron 3 polimorfismos de nucleótido simple (SNPs) en las posiciones 496 bp, 524 bp y 1548 bp de la región CDS, respectivamente. El análisis de haplotipos mostró que estos SNPs estaban en completo desequilibrio de ligamiento y que solo estaban presentes dos haplotipos designados como hap1 (TGG) y hap2 (GAA). El análisis de asociación entre haplotipos y resistencia a PHS de los 20 cultivares de trigo en cuatro entornos experimentales reveló que la resistencia promedio a PHS de los accesos con hap1 fue significativamente mejor que la de los accesos con hap2, lo que infiere los efectos sobre la resistencia a PHS en trigo. Para investigar más a fondo los impactos de los alelos en el locus sobre la resistencia a PHS, el SNP en 1548 bp de la región CDS se convirtió en un marcador KASP, que se utilizó para genotipar 304 cultivares de trigo chinos, cuya resistencia a PHS se evaluó en tres entornos. Las tasas promedio de germinación (SRs) de 135 cultivares de trigo con hap1 fueron significativamente más bajas que las de 169 cultivares con hap2, validando los impactos sobre la resistencia a PHS en el trigo chino. El presente estudio proporcionó el marcador amigable para la cría de variantes funcionales en el gen, que puede ser utilizado para la mejora genética de la resistencia a PHS en trigo.