Aunque los esquemas de cría y selección mejoran los avances genéticos, parece que también resultan en niveles más altos de endogamia, lo que puede afectar negativamente la diversidad genética de las poblaciones de ganado lechero. El presente estudio fue diseñado para analizar el rendimiento reproductivo, la estructura poblacional, la endogamia y la diversidad genética del ganado Montbeliarde ecuatoriano obtenido por cruce de absorción. Se concluyó que las tasas de endogamia y las pérdidas de diversidad genética aumentaron linealmente con el tiempo, estando muy cerca de niveles críticos, lo que podría resultar en efectos negativos sobre los propósitos de conservación del ganado lechero Montbeliarde.