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Análisis Comparativo de los Repertorios de Receptores Olfativos Ilumina la Adaptación Dietética del Panda Gigante que Come Bambú Basado en el Genoma a Nivel de Cromosoma

Autores: Zhou, Chuang; Liu, Yi; Zhao, Guangqing; Liu, Zhengwei; Chen, Qian; Yue, Bisong; Du, Chao; Zhang, Xiuyue

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Análisis Comparativo de los Repertorios de Receptores Olfativos Ilumina la Adaptación Dietética del Panda Gigante que Come Bambú Basado en el Genoma a Nivel de Cromosoma


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Zootecnia

Palabras clave

Panda gigante
Genes OR
Capacidad olfativa
Secuencias genómicas
Especies de Ursidae
árbol filogenético

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 9

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
El panda gigante es el epítome de una especie emblemática para la conservación de la vida silvestre y también un modelo ideal de evolución adaptativa. Como un alimentador obligado de bambú, el panda gigante depende de la olfacción para el reconocimiento de alimentos. El número de genes de receptores olfativos (OR) y la tasa de pseudogenes son los principales factores que afectan la capacidad olfativa de los animales. En este estudio, utilizamos el genoma a nivel de cromosoma del panda gigante para identificar genes OR y comparamos las secuencias genómicas de los genes OR con cinco otras especies de Ursidae (oso de anteojos, oso negro americano, oso pardo, oso polar y oso negro asiático). El panda gigante tenía 639 genes OR, incluidos 408 genes funcionales, 94 genes OR parciales y 137 pseudogenes. Entre ellos, se detectaron 222 genes OR distribuidos en 18 cromosomas, y el cromosoma 8 tenía la mayor cantidad de genes OR. Se identificaron un total de 448, 617, 582, 521 y 792 genes OR en el oso de anteojos, el oso negro americano, el oso pardo, el oso polar y el oso negro asiático, respectivamente. El análisis de agrupamiento basado en las secuencias de proteínas OR de las seis especies mostró que los genes OR se distribuyeron en 69 familias y 438 subfamilias según la similitud de secuencias, y los seis mamíferos compartieron 72 subfamilias de genes OR, mientras que el panda gigante tenía 31 subfamilias de genes OR únicas (que contenían 35 genes). Entre los 35 genes, hay 10 genes agrupados en 8 clústeres con 10 genes OR humanos conocidos (OR8J3, OR51I1, OR10AC1, OR1S2, OR1S1, OR51S1, OR4M1, OR4M2, OR51T1 y OR5W2). Sin embargo, el tipo de moléculas odoríferas que pueden ser reconocidas por los 10 genes OR humanos conocidos por separado, necesita más investigación. El árbol filogenético mostró que 345 (aproximadamente 84.56%) genes OR funcionales se agruparon como Clase-II, mientras que solo 63 (aproximadamente 15.44%) genes OR funcionales se agruparon como Clase-I, lo que requiere más investigación y más en profundidad. La especificidad potencial del olor de algunos genes OR del panda gigante se identificó a través de la similitud con las secuencias de proteínas humanas. Las secuencias similares a OR2B1, OR10G3, OR11H6 y OR11H7P eran específicas del panda gigante, lo que puede estar relacionado con la transformación y especialización del panda gigante de carnívoro a herbívoro. Dado que nuestra referencia a los agentes saborizantes proviene de investigaciones humanas, los posibles agentes saborizantes de los genes OR específicos del panda gigante necesitan más investigación. Además, los motivos conservados de los genes OR estaban altamente conservados en las especies de Ursidae. Este estudio sistemático de los genes OR en el panda gigante proporcionará una base sólida para futuras investigaciones sobre la función olfativa y la variación del panda gigante.

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