Con el fin de satisfacer las necesidades nutricionales globales de una población en crecimiento, se están realizando intentos para desarrollar estrategias que puedan contrarrestar de manera efectiva los efectos negativos de la agricultura intensiva. El objetivo de este estudio fue investigar el efecto de la preparación de Microorganismos Efectivos (EM) y la incorporación de materia orgánica en las características microbiológicas y químicas del suelo. Los análisis incluyeron el número de bacterias heterótrofas, hongos, actinobacterias, microorganismos celulolíticos, amilolíticos y proteolíticos, y bacterias del género. También se determinó el contenido de carbono orgánico, las formas de nitrógeno total y mineral de fósforo, potasio, magnesio y el pH. La aplicación de un EM de dosis más alta combinado con el estiércol y la paja resultó en la mayor abundancia de bacterias heterótrofas (165,1 x 10 ufc g), actinobacterias (43,2 x 10 ufc g), celulolíticas (17,2 x 10 ufc g) y bacterias proteolíticas (82,0 x 10 ufc g). El mayor contenido de parámetros químicos siempre se observó en la variante experimental, incluida la incorporación de biomasa, acompañada del uso de EM. La novedad de nuestra investigación es el análisis del efecto sinérgico de los factores experimentales estudiados en los parámetros microbiológicos y químicos de los suelos cultivables.