Se proporciona un análisis detallado de los cambios en la distribución de Pinus hartwegii Lindl. a lo largo del tiempo para el Parque Nacional Izta-Popo (México). Combinando imágenes satelitales, modelos de distribución de especies y análisis de conectividad, desentrañamos el efecto del cambio climático y el uso del suelo antropogénico en la disponibilidad de hábitat. Veinticuatro modelos de idoneidad de hábitat Maxent con diferentes complejidades se combinaron con información sobre el cambio de vegetación y uso del suelo derivada de dos imágenes satelitales Landsat a 30 m de resolución de 1993 y 2013. Para evaluar los efectos del cambio climático en el bosque de P. hartwegii de Izta-Popo, se derivaron proyecciones para las condiciones climáticas futuras (promediadas para 2050 y 2070) utilizando dos Modelos de Circulación General bajo tres trayectorias representativas de concentración de CO2 (RCPs). Los índices de fragmentación y conectividad calculados (Área Conectada Equivalente y métricas de Probabilidad de Conectividad) mostraron una pérdida significativa de hábitat y fragmentación del hábitat que debilita el flujo de dispersión de P. hartwegii y la fuerza de las conexiones. Las proyecciones de las condiciones climáticas futuras mostraron una reducción de la idoneidad del hábitat de P. hartwegii, ya que las poblaciones tendrían que migrar a altitudes más altas. Sin embargo, el impacto del cambio en el uso del suelo antropogénico documentado durante los 20 años enmascara el impacto previsto del cambio climático en el Parque Nacional Izta-Popo.