Este artículo presenta los resultados de una investigación que se centró en la nutrición y los problemas de salud relacionados de los perros medievales y de la época moderna temprana encontrados en el territorio de la actual Lituania. En este estudio, presentamos las proporciones de isótopos de carbono (C) y nitrógeno (N) del colágeno óseo de setenta y cinco perros recuperados de siete sitios que datan entre los siglos XII y XVIII d.C. Además, al estudiar los restos de casi 200 perros, pudimos estimar cambios en los tamaños y morfotipos de los caninos a lo largo de más de 600 años. Con base en datos de isótopos estables e históricos, así como en el análisis osteométrico, discutimos los patrones dietéticos de diferentes tamaños y tipos de perros de los sitios relacionados con diferentes estratos sociales y períodos de tiempo. Los resultados de nuestro estudio demuestran que el tamaño, tipo, dieta y salud de los caninos de diferentes períodos y entornos socioculturales variaron. En general, las señales isotópicas de carbono indican que las dietas de los perros se basaban en alimentos de un entorno vegetal de C (cereales y animales), mientras que el pescado de agua dulce era más importante para algunos individuos en el castillo costero de Klaipda/Memelburg. El análisis de isótopos estables respaldó los registros históricos, indicando que los cereales eran muy importantes en la dieta de los perros de élite. Mientras tanto, los perros urbanos tenían una nutrición diferente. En la Edad Media, el consumo de alimentos de origen vegetal probablemente fue mayor en comparación con el período moderno temprano. Nuestro estudio también reveló que las dietas de los perros no correlacionaban con el tamaño individual. En comparación con los cerdos, los perros tenían una mayor ingesta de alimentos de origen animal en su dieta. En general, la nutrición de los caninos estudiados era similar a la de la población humana rural del mismo período.