Los mamíferos en tierras secas enfrentan desafíos ambientales exacerbados por el cambio climático. Actualmente, la actividad humana impacta significativamente estos entornos, y sus efectos sobre las demandas energéticas experimentadas por los individuos aún no se han determinado. La demanda de energía en los organismos se gestiona a través de elevaciones en los niveles de glucocorticoides, que también varían con los estados de desarrollo y salud. Aquí, evaluamos cómo la antropización, las características individuales y la estacionalidad influyen en la concentración de glucocorticoides en el pelo del ratón de orejas de hoja de Darwin que habita en dos áreas con intervención antropogénica contrastante en un ecosistema semiárido del norte de Chile. Se recolectaron muestras de pelo (n = 199) para cuantificar la concentración de corticosterona en el pelo (HCC) utilizando ensayos inmunoenzimáticos; además, se registraron el sexo, la condición corporal y la carga de ectoparásitos. No hubo diferencias en HCC entre áreas antropizadas y áreas protegidas de la perturbación humana; sin embargo, se registraron concentraciones más altas en hembras, y los machos experimentaron fluctuaciones estacionales. Los resultados indican que los animales que habitan ecosistemas semiáridos están estresados de manera diferencial dependiendo de su sexo. Además, el sexo y la temporada tienen un mayor impacto en la concentración de corticosterona que la perturbación antropogénica, posiblemente incluyendo factores temporales, precipitación y producción primaria. La influencia del sexo y la estacionalidad en HCC hace necesario incluir estas variables en futuras evaluaciones de estrés de esta especie.