Las fábricas de plantas y los invernaderos de alta tecnología ofrecen la oportunidad de modular el crecimiento de las plantas, la morfología y el contenido cualitativo a través del manejo de la luz artificial (intensidad, fotoperiodo y espectro). En este estudio, se utilizaron tres sistemas de iluminación con Diodos Emisores de Luz (LED), con luz azul (B, 460 nm), roja (R, 650 nm) y luz roja + verde-amarillo + azul (RGB) para cultivar microvegetales de perejil y comprender cómo la calidad de la luz podría cambiar el fenotipo y el perfil de los metabolitos secundarios. Las plantas mostraron características morfológicas alteradas y mayores cantidades de metabolitos secundarios bajo el tratamiento de LEDs RGB. Los resultados demostraron que los microvegetales bajo luz roja mostraron el mayor rendimiento fresco, longitud del pecíolo, contenido de ácido cumárico pero también el mayor contenido de nitrato. Las plantas bajo luz RGB mostraron el mayor porcentaje de materia seca y el mayor contenido de polifenoles totales y simples, mientras que la luz azul mostró el mayor contenido de ácido ascórbico y actividad antioxidante ABTS. Además, los microvegetales bajo luz roja mostraron hojas más compactas con menos espacios intercelulares, mientras que bajo luz azul y RGB, las hojas mostraron mesófilo esponjoso más denso con un mayor porcentaje de espacios intercelulares. Por lo tanto, la banda espectral específica pudo modificar no solo el perfil metabólico, sino también modular la diferenciación de las células del mesófilo. La calidad de la luz como factor previo a la cosecha ayuda a dar forma al producto final de los microvegetales de perejil en su totalidad, no solo en términos de rendimiento y calidad, sino también desde un punto de vista morfo-anatómico.