El presente estudio investigó los efectos del aceite de linaza o del grano de linaza en la microbiota intestinal y los perfiles de ácidos grasos en sangre de las cabras de cachemira Albas. Se asignaron sesenta cabritos a tres tratamientos y se alimentaron durante 90 días con un tratamiento de control, que consistía en una dieta basal (CON, ración total mezclada con harina de linaza), o tratamientos experimentales, que consistían en una dieta basal con aceite de linaza añadido (LNO) y una dieta basal con grano de linaza calentado añadido (HLS). En el día 90, se seleccionaron al azar dos cabras de cada corral (ocho cabras por tratamiento) para ser sacrificadas; luego, se seleccionaron al azar cinco de las ocho cabras y se recolectaron sus digestas intestinales (duodeno, yeyuno, íleon, ciego y colon) para el análisis de la comunidad bacteriana. Los resultados indicaron que los Firmicutes son el filo más predominante en diferentes segmentos de la digesta intestinal. En comparación con el grupo CON, la abundancia relativa de Firmicutes duodenales, Saccharibacteria yeyunales y Verrucomicrobia disminuyó significativamente en los grupos LNO y HLS (< 0.05), pero no hubo diferencia significativa entre los grupos LNO y HLS. En comparación con los grupos CON y HLS, la RA de Proteobacteria duodenales y yeyunales aumentó notablemente en el grupo LNO (< 0.05), y no hubo diferencia significativa entre los grupos CON y HLS. En comparación con los grupos CON y LNO, la RA de Actinobacteria aumentó notablemente en el intestino delgado del grupo HLS (< 0.05), pero no hubo diferencia significativa entre los grupos CON y LNO en el duodeno y el íleon. Los resultados del análisis de tamaño del efecto del análisis de discriminante lineal (LDA) mostraron que el grupo HLS se caracterizó por una mayor RA del grupo [Eubacterium]_coprostanoligenes en el intestino delgado y el grupo LNO se representó por una mayor RA del grupo Lachnospiraceae_NK3A20 en el ciego y el colon, mientras que el grupo CON se representó por una mayor RA de Solobacterium, Pseudoramibacter y Acetitomaculum en el intestino delgado y una mayor RA de norank_o__Bradymonadales, el grupo Prevotellaceae_Ga6A1 y Ruminiclostridium_1 en el ciego y el colon. En conclusión, la adición de aceite de linaza y grano rico en c18:3n3 a la dieta podría reducir la diversidad microbiana de los segmentos del intestino delgado y la diversidad y riqueza microbiana del ciego y el colon en las cabras de cachemira Albas. Y el grano de linaza es más eficiente que el aceite de linaza en proteger la salud intestinal y promover la absorción de c18:3n3.