Las prácticas agrícolas intensivas han llevado a una intensa degradación del suelo y pérdidas de fertilidad del suelo. Muchas enfermedades transmitidas por el suelo afectan a estos suelos agrícolas intensivos, empeorando los desequilibrios físico-químicos y de fertilidad. Entre los numerosos patógenos, el género Fusarium incluye miembros que destruyen muchos cultivos, incluido Crocus sativus L., que también afecta la composición y funciones de las comunidades microbianas. Este trabajo tuvo como objetivo investigar, por primera vez, las comunidades bacterianas de la rizosfera del azafrán en presencia y ausencia de fusariosis. Se muestrearon la rizosfera de los campos de azafrán en el territorio de L"Aquila (Italia) con y sin fusariosis y se sometieron a un análisis microbiológico. Se caracterizó la fusariosis mediante métodos dependientes de cultivo. Se estimó el ensayo de actividad de deshidrogenasa. También se realizaron el metabarcoding del gen 16S rRNA, una predicción de funciones del metagenoma y un análisis de red. Los resultados mostraron que la fusariosis, cuando está vinculada a prácticas agrícolas intensivas, causa alteraciones en las comunidades microbianas de la rizosfera. Los enfoques dependientes e independientes de cultivo han mostrado cambios en la comunidad bacteriana en presencia de fusariosis, con desequilibrios funcionales y enzimáticos. Las muestras mostraron una prevalencia de taxones no cultivados y desconocidos. La mayoría de los variantes de secuencia de amplicón (ASVs) conocidos estaban asociados con la línea de Pseudomonadoa (sin. Proteobacteria). La composición y riqueza de este filo se alteraron significativamente por la presencia de Fusarium. Además, la patogénesis pareció mejorar las interconexiones de los ASVs. Las funciones del metagenoma también se modificaron en presencia de fusariosis.