La descomposición de fuentes de carbono compuestas biodegradables genera una gran cantidad de microplásticos biodegradables, que no solo pueden proporcionar desnitificación microbiana, sino que también pueden representar riesgos ambientales potenciales. En el presente estudio, se exploraron los efectos de diferentes dosis de una fuente de carbono compuesta biodegradable sobre las comunidades microbianas, las vías metabólicas del nitrógeno y el resistoma de antibióticos a través de análisis de secuenciación Illumina MiSeq y análisis metagenómico. Los resultados del análisis discriminante de mínimos cuadrados parciales (PLS-DA) y del análisis de similitud (ANOSIM) demostraron que la respuesta de la comunidad bacteriana a una fuente de carbono compuesta biodegradable fue más evidente que la de la comunidad fúngica. La aplicación de microplásticos biodegradables disminuyó la complejidad de las comunidades microbianas hasta cierto punto y estimuló claramente la desnitificación. La dispersión de genes de resistencia a antibióticos (ARG) no se aceleró evidentemente tras la adición de la fuente de carbono compuesta biodegradable. En general, la adición de una fuente de carbono compuesta biodegradable moldeó las comunidades microbianas y sus perfiles de resistencia a antibióticos en este estudio.