El objetivo de este estudio fue examinar cómo varios métodos de anclaje impactan en la distalización a largo plazo del arco completo maxilar utilizando alineadores transparentes (AT) a través de una simulación de estadiaje automatizada. Tres diferentes métodos de refuerzo de anclaje, a saber, elásticos de Clase II, dispositivo temporal de anclaje bucal (TAD) y TAD palatino, fueron diseñados. El movimiento dental ortodóncico inducido por fuerzas ortodóncicas fue simulado utilizando un método de cálculo iterativo. Además, se simuló el ajuste automático del AT mediante la aplicación del método de expansión térmica. Los resultados indicaron que el grupo de TAD palatino tuvo la mayor retracción de incisivos, seguido por el grupo de TAD bucal y el grupo de elásticos de Clase II, mientras que la menor fue en el grupo de control. Las mayores desplazamientos distales y eficiencia de distalización de molares para el primer y segundo molares se observaron en el grupo de TAD palatino. El ancho del arco aumentó en los niveles de molares y premolares en todos los grupos. Los resultados del MEF sugirieron que el TAD palatino tuvo el mejor rendimiento considerando el mantenimiento del anclaje de los dientes anteriores, tanto sagital como verticalmente. Sin embargo, se debe prestar atención al posible aumento del ancho del arco.