La linfadenitis caseosa (CLA) es una infección bacteriana causada por () que afecta a ovejas y cabras, lo que lleva a la formación de abscesos en sus ganglios linfáticos. El presente estudio tuvo como objetivo aislar e identificar de CLA en ovejas y cabras de pequeños productores, y determinar los patrones de resistencia, virulencia y genes de resistencia de los aislamientos. Además, se realizó un análisis genotípico y filogenético de los aislamientos utilizando técnicas de ERIC-PCR y secuenciación de ADN. Un estudio transversal examinó 220 animales (130 ovejas y 90 cabras) de 39 rebaños de pequeños productores en busca de signos clínicos de CLA. Cincuenta y cuatro (24.54%) animales mostraron lesiones compatibles con CLA, confirmadas por aislamiento e identificación por PCR. Las ovejas tuvieron una tasa de infección más baja de CLA (18.46%) en comparación con las cabras (33.3%). Las pruebas de susceptibilidad antimicrobiana de 54 aislamientos a 24 fármacos antimicrobianos revelaron que eran 100% resistentes a la bacitracina y al florfenicol, mientras que ninguno de los aislamientos fue resistente a la norfloxacina. Se observó una alta tasa de resistencia para la penicilina y la eritromicina (92.6% cada una). Curiosamente, el 16.7% de los aislamientos recuperados de ovejas mostraron resistencia a la vancomicina. La caracterización molecular de los aislamientos reveló que , , y los genes de virulencia estaban presentes en todos los aislamientos examinados. Sin embargo, los genes , , y fueron detectados en 24 (100%), 20 (83%) y 18 (75%) de los aislamientos de ovejas, y 26 (87%), 26 (87%) y 18 (60%) de los aislamientos de cabras, respectivamente. El gen de resistencia a -lactámicos estaba presente en todos los aislamientos. Además, el 83% de los aislamientos de ovejas portaban los genes de resistencia a aminoglucósidos (), cloranfenicol () y bacitracina (). Entre los aislamientos recuperados de cabras, se encontró que el 73% contenía genes de resistencia a macrólidos (), sulfonamidas () y bacitracina (). Es preocupante que el gen de resistencia a glicopéptidos () se detectara en el 8% de los aislamientos de ovejas como un primer informe. La genotipificación por ERIC-PCR de 10 aislamientos multirresistentes mostró un alto índice de similitud del 83.6% entre los aislamientos de ovejas y cabras. El análisis de secuencia de nucleótidos de secuencias parciales de 16S rRNA reveló un 98.83% de similitud con biovar de secuencias de referencia disponibles globalmente en la base de datos Genbank. En general, nuestros hallazgos podrían indicar que la infección en pequeños productores en Egipto podría estar subestimada a pesar del impacto financiero significativo en la ganadería y los posibles riesgos para la salud que plantea. Además, este estudio destaca la importancia de implementar una estrategia de control sostenible y aumentar el conocimiento y la conciencia entre los criadores de pequeños productores para mitigar el impacto económico de la CLA.