La cola mueve el SINE del perro: Mecanismos retroposicionales de cómo el SINE puede depender de su estructura de cola A
Autores: Kosushkin, Sergei A.; Ustyantsev, Ilia G.; Borodulina, Olga R.; Vassetzky, Nikita S.; Kramerov, Dmitri A.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
La cola mueve el SINE del perro: Mecanismos retroposicionales de cómo el SINE puede depender de su estructura de cola A
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Sines
Transcripciones
Poliadenilación
Pueden subfamilias
Retrotransposición
Terminador
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 16
Citaciones: Sin citaciones
Los SINEs, retrotransposones cortos no autónomos, son comunes en los genomas de mamíferos. Sus transcritos son generados por la ARN polimerasa III (pol III). Los transcritos de ciertos SINEs pueden ser poliadenilados, lo que requiere señales de poliadenilación y de terminación de pol III en sus secuencias. Nuestro análisis de secuencias dividió los SINEs caninos en cuatro subfamilias: las más antiguas a1 y a2, y las más jóvenes b1 y b2. Can_b2 y, en menor medida, Can_b1 permanecieron activos en retrotransposición, mientras que la amplificación de Can_a1 y Can_a2 cesó hace mucho tiempo. Se reveló una amplificación extraordinariamente alta de Can en diferentes razas de perros. Se analizaron señales funcionales de poliadenilación en las subfamilias de Can, particularmente en fracciones de copias recientemente amplificadas, es decir, activas. La transcripción de varios constructos de Can transfectados en células HeLa propuso AATAAA y (TC) como señales funcionales de poliadenilación. Nuestro análisis indica que las subfamilias más antiguas de Can (a1, a2 y b1) con un terminador de transcripción activo fueron amplificadas por el mecanismo T (con poliadenilación de los transcritos de pol III). En la actualmente activa subfamilia Can_b2, los mecanismos de amplificación con (T) y sin la poliadenilación de los transcritos de pol III (T) alternan de manera irregular. El terminador de transcripción activo tiende a acortarse, lo que lo vuelve no funcional y favorece un cambio hacia la retrotransposición T. La actividad de un terminador truncado se restaura ocasionalmente mediante su elongación, lo que rehabilita la retrotransposición T para una copia particular de SINE.
Descripción
Los SINEs, retrotransposones cortos no autónomos, son comunes en los genomas de mamíferos. Sus transcritos son generados por la ARN polimerasa III (pol III). Los transcritos de ciertos SINEs pueden ser poliadenilados, lo que requiere señales de poliadenilación y de terminación de pol III en sus secuencias. Nuestro análisis de secuencias dividió los SINEs caninos en cuatro subfamilias: las más antiguas a1 y a2, y las más jóvenes b1 y b2. Can_b2 y, en menor medida, Can_b1 permanecieron activos en retrotransposición, mientras que la amplificación de Can_a1 y Can_a2 cesó hace mucho tiempo. Se reveló una amplificación extraordinariamente alta de Can en diferentes razas de perros. Se analizaron señales funcionales de poliadenilación en las subfamilias de Can, particularmente en fracciones de copias recientemente amplificadas, es decir, activas. La transcripción de varios constructos de Can transfectados en células HeLa propuso AATAAA y (TC) como señales funcionales de poliadenilación. Nuestro análisis indica que las subfamilias más antiguas de Can (a1, a2 y b1) con un terminador de transcripción activo fueron amplificadas por el mecanismo T (con poliadenilación de los transcritos de pol III). En la actualmente activa subfamilia Can_b2, los mecanismos de amplificación con (T) y sin la poliadenilación de los transcritos de pol III (T) alternan de manera irregular. El terminador de transcripción activo tiende a acortarse, lo que lo vuelve no funcional y favorece un cambio hacia la retrotransposición T. La actividad de un terminador truncado se restaura ocasionalmente mediante su elongación, lo que rehabilita la retrotransposición T para una copia particular de SINE.