El intercultivo y la aplicación de fósforo son formas efectivas de aumentar el rendimiento de los cultivos y mejorar la calidad del suelo. Sin embargo, los efectos del intercultivo y la aplicación de fósforo en las propiedades del suelo de rizosfera, la morfología de las raíces y las características microbianas aún no están claros. Este estudio se centra en los efectos del intercultivo y la aplicación de fertilizantes fosfatados (180 kg PO ha) en las propiedades fisicoquímicas, la actividad enzimática, la morfología de las raíces y las características microbianas del suelo de rizosfera en un campo de intercultivo de maíz-cacahuete plantado durante 14 años. Los resultados mostraron que en comparación con el monocultivo, el intercultivo aumentó los contenidos de carbono y nutrientes. La aplicación de fertilizantes fosfatados aumentó aún más los contenidos de nutrientes del suelo de rizosfera. En comparación con el monocultivo, el intercultivo aumentó la ureasa y sacarasa en un 14,00% y 7,16% en el suelo de rizosfera, y la aplicación de fósforo aumentó la ureasa, fosfatasa alcalina y sacarasa en el suelo de rizosfera en un 13,38%, 9,75% y 24,20% en comparación con la no aplicación de fósforo. En comparación con el monocultivo, el intercultivo aumentó la longitud de las raíces, el área superficial de las raíces, el volumen de las raíces y el número de puntas de raíces en un 19,17%, 21,57%, 20,74% y 28,54%, y la aplicación de fertilizantes fosfatados aumentó aún más la longitud de las raíces, el área superficial de las raíces y el volumen de las raíces en un 44,66%, 40,20% y 41,70%. En comparación con el monocultivo, el intercultivo aumentó el índice Chao y el índice Shannon de las bacterias y hongos del suelo de rizosfera en un 4,29% y 1,63%, y un 27,25% y 7,68%. El intercultivo y la aplicación de fósforo aumentaron el número de bordes y la modularidad de la red de comunidades bacterianas y fúngicas. En resumen, el intercultivo de maíz y cacahuete mejoró los contenidos de nutrientes y la actividad enzimática del suelo de rizosfera, promovió el crecimiento del sistema de raíces y mejoró la diversidad y conectividad de las comunidades microbianas de la rizosfera, y la aplicación de fertilizante fosfatado optimizó aún más el ambiente microecológico del suelo de rizosfera. Los resultados de la investigación proporcionan una base teórica para mantener la estabilidad y el desarrollo sostenible del microecosistema en un campo de intercultivo de maíz-cacahuete.