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Perspectivas sobre la composición genética mitocondrial y la colonización miocena de los peces planos primitivos (Pleuronectiformes: Psettodidae) en el Atlántico Este y el Océano Indo-Pacífico Occidental

Autores: Kundu, Shantanu; Palimirmo, Flandrianto Sih; Kang, Hye-Eun; Kim, Ah Ran; Lee, Soo Rin; Gietbong, Fantong Zealous; Song, Se Hyun; Kim, Hyun-Woo

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Perspectivas sobre la composición genética mitocondrial y la colonización miocena de los peces planos primitivos (Pleuronectiformes: Psettodidae) en el Atlántico Este y el Océano Indo-Pacífico Occidental


Categoría

Ciencias Naturales y Subdisciplinas

Subcategoría

Biología

Palabras clave

Mitogenómica
Peces planos
Camino evolutivo
Genes
Tiempo de divergencia
Conservación

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 18

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
La evolución mitogenómica de los peces planos aún se conoce poco en función de su distribución en el Atlántico oriental y los océanos Indo-Pacífico. El estudio profundiza en la trayectoria evolutiva matrilineal de estos peces planos primitivos, con un enfoque específico en el mitogenoma completo de la especie, determinado a través de secuenciación de nueva generación. El mitogenoma en cuestión abarca una longitud de 16,747 pares de bases y comprende un total de 37 genes, incluidos 13 genes que codifican proteínas, 2 genes de ARN ribosómico, 22 genes de ARN de transferencia y una región de control. Notablemente, el mitogenoma exhibe un sesgo hacia los pares de bases AT, con una composición del 54.15%, reflejando un sesgo similar observado en su pariente cercano, que muestra porcentajes de 53.07% y 53.61%. La mayoría de los genes que codifican proteínas comienzan con un codón de inicio ATG, excepto el citocromo c oxidasa I (COI), que inicia con un codón GTG. Además, cuatro genes que codifican proteínas comienzan con un codón de terminación TAA, mientras que otros siete presentan codones de terminación incompletos. Además, dos genes que codifican proteínas, a saber, NAD1 y NAD6, terminan con codones de parada AGG y TAG, respectivamente. En el mitogenoma de, la mayoría de los ARN de transferencia demuestran las clásicas estructuras secundarias en forma de trébol, excepto el tRNA-serina, que carece de un tallo DHU. El análisis comparativo de bloques conservados dentro de las regiones de control de dos especies de Psettodidae reveló que el bloque CSB-II se extendió a una longitud de 51 pares de bases, superando a los otros bloques y abarcando sitios altamente variables. Un análisis filogenético integral utilizando genomas mitocondriales (13 PCGs concatenados) categorizó varias especies de Pleuronectiformes, destacando la posición basal de la familia Psettodidae y mostró un agrupamiento monofilético de especies. Se estimó el tiempo de divergencia aproximado (35-10 MYA) entre y, proporcionando información sobre su separación y colonización durante el Mioceno temprano. El análisis de TimeTree también estimó la divergencia de dos subórdenes, Psettodoidei y Pleuronectoidei, durante el Paleoceno tardío hasta el Eoceno temprano (56.87 MYA). Los patrones de distribución de los peces planos fueron influenciados por las corrientes oceánicas y las condiciones ambientales, contribuyendo a su especiación ecológica. Ante el cambio climático y las actividades antropogénicas, se enfatizan las implicaciones de conservación de los peces planos, subrayando la necesidad de una cosecha regulada y estrategias de gestión adaptativa para garantizar su supervivencia en ecosistemas marinos en cambio. En general, este estudio contribuye a la comprensión de la historia evolutiva, la diversidad genética y las necesidades de conservación de los peces planos a nivel global. Sin embargo, la exploración multifacética del mitogenoma y los datos genómicos a mayor escala de los peces planos proporcionará información invaluable sobre su caracterización genética, historia evolutiva, adaptación ambiental y conservación en los océanos Atlántico oriental e Indo-Pacífico.

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