Los fitoplasmas son bacterias limitadas al floema que no pueden cultivarse in vitro. Se amplificaron y analizaron los genes de la timidilato quinasa de 50 cepas de fitoplasmas que infectan cultivares de jujube con diferentes resistencias en China. Se identificaron dos tipos de secuencia y las 50 cepas de fitoplasma JWB se clasificaron en tres tipos: tipo-X, tipo-Y y tipo-XY, basándose en los tipos de secuencia. Las cepas tipo-X, tipo-Y y tipo-XY representaron el 42%, 12% y 46% de todas las cepas, respectivamente. Las cepas con se pudieron identificar en cultivares de jujube susceptibles y resistentes, mientras que las cepas solo con se identificaron únicamente en cultivares susceptibles. El análisis filogenético mostró que los genes de los fitoplasmas se dividieron en dos clados. Los genes en un clado estaban copiados una sola vez en el genoma con un patrón evolutivo similar al gen del ARNr 16S; los genes en el otro clado estaban copiados múltiples veces relacionados con la transposición dentro del genoma mediada por PMU y la transferencia entre genomas. Este estudio beneficiará la comprensión de las variaciones genéticas y los mecanismos detrás de la evolución adaptativa de los fitoplasmas.