El consumo de trigo integral se ha asociado con resultados positivos para la salud, pero sigue sin estar claro si diferentes tipos de trigo provocan efectos variados en el microbioma intestinal y la inflamación intestinal. Los objetivos de esta investigación fueron investigar el efecto de dos harinas de trigo integral en comparación con la harina de trigo refinada sobre la diversidad de la microbiota intestinal humana, así como sobre la capacidad de producción de butirato y la inflamación gastrointestinal, utilizando intervenciones dietéticas de una semana. Para este estudio, se reclutaron 28 participantes, con edades que oscilaban entre 18 y 55 años y un IMC medio de 26.0 kg/m. Durante cuatro semanas, se proporcionaron a los participantes raciones diarias de 80 g de diferentes galletas de trigo: la Semana A fue un período de adaptación con galletas hechas de harina de trigo blanco suave, las galletas de la Semana B eran de harina de trigo integral blanco suave, las galletas de la Semana C fueron un período de lavado idéntico a la Semana A, y las galletas de la Semana D eran de harina de trigo integral rojo suave. Al final de cada semana, los participantes proporcionaron muestras fecales que fueron analizadas en busca de marcadores de inflamación intestinal, incluyendo lipocalina y calprotectina, utilizando ensayos inmunoenzimáticos y PCR cuantitativa en tiempo real. El resultado principal, la diversidad alfa y beta de la comunidad bacteriana intestinal, fue similar a lo largo de los puntos temporales. Tres taxones diferían significativamente en abundancia tras ambas intervenciones de harina de trigo integral: y fueron significativamente reducidos, y el grupo fue enriquecido. Los resultados secundarios determinaron que los marcadores proteicos de inflamación intestinal y los genes relacionados con la capacidad de producción de butirato fueron similares durante todo el período del estudio, sin cambios significativos. Las concentraciones de lipocalina variaron de 14.8 a 22.6 ng/mL mientras que la calprotectina varió de 33.2 a 62.5 ng/mL a lo largo de las 4 semanas. La adición de galletas de trigo a la dieta habitual de los sujetos humanos adultos tuvo un impacto mínimo en su inflamación gastrointestinal o en la microbiota intestinal.