La sostenibilidad de los sistemas actuales de agricultura ha sido cuestionada en las últimas décadas, especialmente en términos del impacto ambiental y la mitigación del calentamiento global. Además, el sector orgánico, que se supone que impacta menos en el medio ambiente que otros sistemas más intensivos, está buscando soluciones innovadoras para mejorar su sostenibilidad ambiental. Prometedoramente, la integración de prácticas de gestión orgánica con técnicas de agricultura de conservación puede ayudar a aumentar la sostenibilidad ambiental de la producción de alimentos. Sin embargo, se sabe poco sobre el posible impacto de la agricultura de conservación en el contenido de compuestos bioactivos en los cultivos comerciales. Por esta razón, un experimento de rotación de dos años utilizó 7 cultivos comerciales (4 hortalizas de hoja y 3 cultivos de frutas) para comparar sistemas integrados (INT), agricultura orgánica (ORG) y sistemas orgánicos de no labranza (ORG+) para evaluar la posible influencia de los sistemas de cultivo en los valores nutricionales/nutracéuticos de las frutas y hortalizas obtenidas. Los resultados señalaron respuestas específicas basadas en la especie, así como en el año de cultivo. Sin embargo, el cultivo con el sistema de cultivo ORG+ resultó en la obtención efectiva de frutas y hortalizas con niveles más altos de compuestos bioactivos en varios casos (11 de 16 observaciones). Los resultados del sistema de cultivo ORG+ son particularmente prometedores para el cultivo de hortalizas de hoja, especialmente cuando se lleva a cabo ORG+ de forma multianual. Conscientes de que los datos obtenidos deberían consolidarse con experimentos a más largo plazo, concluimos que este conjunto de datos puede representar un buen punto de partida para apoyar los sistemas de agricultura de conservación como una posible estrategia sostenible para obtener productos con niveles más altos de compuestos bioactivos.