El nitrógeno es un elemento clave para promover el crecimiento y desarrollo de los cultivos y mejorar la fotosíntesis. Este estudio tuvo como objetivo analizar la respuesta de dos genotipos de arroz a la restauración del suministro de nitrógeno después de diferentes períodos de deficiencia de nitrógeno. Utilizamos el arroz tolerante a bajos niveles de nitrógeno Jijing 88 (JJ 88) y la variedad de arroz sensible al nitrógeno Xinong 999 (XN 999) como materiales de prueba. Los resultados de este estudio indicaron que, en comparación con XN 999, JJ 88 tiene un mayor contenido de pigmentos fotosintéticos. La fotosíntesis en JJ 88 tiene una fuerte adaptabilidad en condiciones de bajo nitrógeno. Al aumentar el nivel de suministro de nitrógeno, la tasa máxima de regeneración de ribulosa bifosfato (RuBP) y la tasa máxima de carboxilación de RuBP en JJ 88 mostraron un aumento relativamente grande. Los parámetros de fluorescencia de clorofila, incluyendo el rendimiento cuántico efectivo del fotosistema II, la eficiencia de captura de excitación por centros PSII abiertos (Fv/Fm), el quenching de fluorescencia fotocanónica (qP) y la tasa de transferencia de electrones (ETR) disminuyeron ligeramente, mientras que el quenching de fluorescencia no fotocanónica (NPQ) aumentó ligeramente. En condiciones de bajo nitrógeno, las variedades de arroz tolerantes a bajos niveles de nitrógeno mantienen un crecimiento razonable durante la etapa de plántula. Con un aumento en el nivel de suministro de nitrógeno, la acumulación de materia seca, el contenido de pigmentos fotosintéticos, la fotosíntesis y la capacidad de transferencia de electrones de las plantas mejoran, pero no alcanzan niveles normales de suministro de nitrógeno. Sin embargo, en comparación con XN 999, JJ 88 tiene una capacidad de recuperación más proactiva. Los resultados de la investigación proporcionan una guía valiosa para la cría de variedades de arroz eficientes en nitrógeno y la gestión de fertilizantes nitrogenados.