El fotoperíodo puede regular la incubación de las gansos y, por lo tanto, aumentar su tasa de puesta de huevos. El rendimiento de puesta de los gansos está determinado principalmente por el desarrollo del ovario y de los folículos. Para entender el efecto del fotoperíodo en el ovario y los pequeños folículos blancos, dieciséis gansos hembra Zhedong blancos de 220 días de edad fueron divididos aleatoriamente en dos grupos para fotoperíodos largos (15L:9D) y fotoperíodos cortos (9L:15D). Los gansos fueron sacrificados después de dos meses de alimentación, y sus ovarios y folículos fueron recolectados para secuenciación de transcriptomas. El análisis de RNA-seq identificó 187 y 448 genes expresados diferencialmente en ovarios y pequeños folículos blancos de diferentes grupos de fotoperíodo, respectivamente. Un fotoperíodo largo promueve la alta expresión de genes en los ovarios y aumenta la expresión de genes en pequeños folículos blancos. El análisis de enriquecimiento funcional mostró que el fotoperíodo podría afectar el desarrollo del sistema respiratorio, la proliferación de células musculares lisas en los ovarios y la función relacionada con la matriz extracelular en pequeños folículos blancos. WGCNA reveló 31 módulos de genes, de los cuales 2 estaban significativamente asociados con el peso ovárico y 17 con el número de pequeños folículos blancos. Nuestros resultados proporcionan una mejor comprensión de la regulación molecular en el fotoperíodo que afecta la reproducción de los gansos.