El selenio (Se) es un elemento traza esencial en los sistemas vivos. En este estudio, aplicamos una pulverización de 50 mg/kg de selenito de sodio a la alfalfa (Medicago sativa L.) en diferentes etapas de desarrollo (capullo, floración inicial y plena floración). Después de 0, 1, 3, 7 y 45 días de ensilaje, evaluamos la calidad de la fermentación, la composición química y la comunidad bacteriana de la alfalfa. Nuestros hallazgos indicaron que la adición de Se condujo a un aumento en el contenido de Se y una disminución en el pH, fibra detergente ácida (ADF) y contenido de fibra detergente neutra (NDF). A medida que progresaba la fermentación del ensilaje, los tratamientos de Se aumentaron la abundancia relativa de , que fue significativamente mayor que la del grupo de control (42.44% vs. 3.76%). En conclusión, la adición de seleniato de sodio al aditivo para ensilaje asegura la calidad del ensilaje y reduce la diversidad de la comunidad bacteriana. Este estudio proporciona información valiosa para la investigación del enriquecimiento de Se en el ensilaje de heno de alfalfa.