Las intrusiones magmáticas afectan la temperatura de la cuenca en su vecindad. La fallas y las propiedades físicas de la cuenca pueden influir en las magnitudes de sus efectos térmicos y en la posible maduración de las rocas fuente. Presentamos resultados de un estudio de sensibilidad de los factores más importantes que afectan la historia térmica en cuencas sedimentarias estructuralmente complejas con intrusiones de sills magmáticos. Estos factores están relacionados con la falla, las propiedades físicas y los métodos de restauración: (1) desplazamiento de la falla, (2) período de tiempo de la falla y deposición, (3) ángulo de la falla, (4) conductividad térmica y capacidad calorífica específica, (5) flujo de calor basal y (6) método de restauración. Todo el modelado se realiza en el mismo perfil sedimentario clástico construido que contiene una falla listrica normal con un evento de falla. Los sills se modelan para intruir en cualquiera de los lados de la zona de falla con una temperatura de 1000 grados C. Los resultados muestran que los efectos térmicos transitorios pueden durar hasta varios millones de años después del deslizamiento de la falla. Las diferencias térmicas de hasta 40 grados C podrían ocurrir para los sills que intruyen en el momento del deslizamiento de la falla, en comparación con los sills que intruyen 10 millones de años después. Hemos demostrado que omitir los efectos térmicos transitorios del desarrollo estructural en cuencas con intrusiones magmáticas puede llevar a una sobreestimación o subestimación de los efectos térmicos de las intrusiones magmáticas y, en última instancia, de la maduración estimada.