La exposición electromagnética se ha vuelto cada vez más generalizada, y sus efectos biológicos han recibido una atención extensa. El propósito de este estudio fue explorar los cambios en el perfil metabólico del cerebro y suero e identificar proteínas expresadas diferencialmente en el cerebro después de la exposición al campo de radiofrecuencia (RF) de 4.9 GHz. Los ratones C57BL/6 fueron divididos aleatoriamente en un grupo de control y un grupo de RF, que fueron expuestos de manera simulada y continuamente a un campo de RF de 4.9 durante 35 días, 1 hora/día, a una densidad de potencia promedio (PD) de 50 W/m. Después de la exposición, se realizaron metabolómica no dirigida y proteómica cuantitativa con etiquetas de masa en tándem (TMT). Encontramos 104 y 153 metabolitos expresados diferencialmente (DEMs) regulados al alza y a la baja en el grupo RF_Cerebro y el grupo RF_Suero, y los DEMs estaban significativamente enriquecidos en el metabolismo de glicerofosfolípidos. Además, se descubrieron 10 proteínas expresadas diferencialmente (DEPs) reguladas al alza y 51 reguladas a la baja en el grupo RF. El análisis de correlación funcional mostró que la mayoría de los DEMs y DEPs mostraron una correlación significativa. Estos resultados sugieren que la exposición a 4.9 GHz indujo una alteración del metabolismo en el cerebro y suero, y causó una desregulación de proteínas en el cerebro.