Se ha informado que varios retardantes de llama brominados (BFR) interfieren con la vía de señalización tiroidea y causan estrés oxidativo en las aves, sin embargo, los cambios subyacentes en la expresión génica asociados con estos efectos siguen siendo poco comprendidos. En este estudio, medimos las respuestas transcripcionales hepáticas de 31 genes en los polluelos de cernícalo americano tras la exposición in ovo a uno de tres BFR alternativos de alto volumen: 1,2-bis(2,4,6-tribromofenoxi)etano (BTPBE), bis(2-etilhexilo)-2,3,4,5-tetrabromoftalato (TBPH) o 2-etilhexilo-2,3,4,5-tetrabromobenzoato (EHTBB). Los polluelos de cernícalo mostraron cambios en la expresión de genes relacionados con el estrés oxidativo, el metabolismo y transporte de hormonas tiroideas, el metabolismo de lípidos y proteínas, y la inflamación mediada por citoquinas. Los polluelos machos y hembras diferían en qué genes se expresaban diferencialmente, así como en la dirección del efecto (regulación al alza vs. regulación a la baja). Estos resultados se basan en nuestros hallazgos previos de aumento del estrés oxidativo y alteración de la vía de señalización tiroidea en los mismos polluelos. Además, nuestros resultados indican que las respuestas inflamatorias parecen ocurrir en los polluelos hembras expuestos a BTBPE y EHTBB in ovo. El análisis de expresión génica reveló múltiples vías afectadas, añadiendo a la creciente evidencia de que los efectos fisiológicos subletales son complejos y son una preocupación para las aves expuestas a BTBPE, EHTBB o TBPH in ovo.