Investigaciones previas han encontrado conexiones entre la pigmentación, el comportamiento y la respuesta fisiológica al estrés en animales salvajes y domésticos; sin embargo, hasta la fecha, no se ha dedicado una investigación extensa a responder estas preguntas en perros domésticos. Los perros modernos están expuestos a una variedad de estresores; uno de los estresores bien estudiados es residir en un refugio de animales. Para explorar las posibles relaciones entre las respuestas de los perros al estrés y su pigmentación, realizamos análisis estadísticos de las proporciones de cortisol:creatinina de 208 perros de refugio americanos en función de su color/patrón de pelaje, pigmentación de eumelanina o manchas blancas. Estos perros habían sido incluidos en estudios previos de bienestar que investigaban el efecto de intervenciones durante las cuales dejaron el refugio de animales y pasaron tiempo con humanos. En la investigación actual, fenotipamos visualmente a los perros basándonos en fotografías para clasificar su pigmentación y luego realizar análisis post hoc para examinar si experimentan estrés de manera diferencial en función de la pigmentación. Encontramos que los perros no diferían significativamente en sus proporciones de cortisol:creatinina urinaria según el color/patrón de pelaje, la pigmentación de eumelanina o las manchas blancas, ya sea mientras residían en el refugio de animales o durante la intervención de interacción humana. Estos datos preliminares sugieren que la pigmentación por sí sola no predice las respuestas al estrés de los perros de refugio; sin embargo, debido al pequeño tamaño de la muestra y la naturaleza retrospectiva del estudio, se necesita más investigación.