La vegetación y los microorganismos del suelo son componentes importantes de los ecosistemas terrestres y desempeñan un papel crucial en el funcionamiento del ecosistema. Sin embargo, se sabe poco sobre los cambios sinérgicos en la comunidad microbiana del suelo con las plantas sobre el suelo en la degradación de pastizales y el papel de la comunidad microbiana en el proceso de sucesión de restauración de la vegetación. En este estudio, investigamos las características de las comunidades microbianas del suelo y sus diversidades en los diferentes niveles de degradación de pastizales utilizando secuenciación de alto rendimiento Illumina MiSeq. Los filos bacterianos dominantes fueron: Actinobacteriota, 31.61-48.90%; Acidobacteriota, 7.19-21.73%; Chloroflexi, 9.08-19.09%; y Proteobacteria, 11.14-18.03%. Mientras que los filos fúngicos dominantes fueron: Ascomycota, 46.36-81.58%; Basidiomycota, 5.63-33.18%; y Mortierellomycota, 1.52-37.69%. A través de RDA/CCA, se interpretaron los efectos de los factores ambientales en las diferencias en la comunidad microbiana del suelo entre los diferentes sitios. Los resultados mostraron que el pH fue el factor más crítico que afectaba a las comunidades microbianas del suelo en pastizales gravemente degradados; sin embargo, las comunidades microbianas del suelo en pastizales no degradados y menos degradados fueron principalmente afectadas por el contenido de humedad del suelo y las actividades enzimáticas del suelo (actividad de sucrasa, actividad de fosfatasa alcalina y actividad de catalasa). Demostramos sistemáticamente las comunidades microbianas del suelo de diferentes gradientes de degradación de pastizales en Mongolia, lo que proporcionó información valiosa para la reducción de la degradación de pastizales y la sucesión de restauración de la vegetación.