El objetivo de este estudio fue evaluar la diversidad genética entre accesiones tradicionales de frijol común a través de descriptores morfológicos y marcadores moleculares. Se evaluaron sesenta y siete accesiones de frijol común del banco de germoplasma del Instituto Federal de Espírito Santo-Campus de Alegre. Para ello, se utilizaron 25 descriptores morfológicos específicos, a saber, 12 cuantitativos y 13 cualitativos. Se realizó un análisis de diversidad basado en descriptores morfológicos utilizando el algoritmo de Gower. Para la caracterización molecular, se utilizaron 23 cebadores ISSR para estimar la disimilitud utilizando el Índice de Jaccard. Basado en los dendrogramas obtenidos por el método UPGMA, para la caracterización morfológica y molecular, se observó una alta variabilidad genética entre los genotipos de frijol común estudiados, evidenciada por valores de correlación cophenética en el orden de 0.99, lo que indica una representación precisa de la matriz de disimilitud por el agrupamiento UPGMA. En la caracterización morfológica, se observó una alta diversidad fenotípica entre las accesiones, con granos de diferentes formas, colores y tamaños, y las accesiones se agruparon en nueve grupos distintos. La caracterización molecular fue eficiente en separar los genotipos en los grupos andinos y mesoamericanos, con los 23 cebadores ISSR estudiados generando un promedio de 6.35 bandas polimórficas. El trabajo identificó accesiones divergentes que pueden servir a diferentes nichos de mercado, las cuales pueden ser indicadas como padres para formar programas de mejoramiento con el fin de obtener progenies con alta variabilidad genética.