El objetivo de la terapia endodóntica es utilizar varios medicamentos antimicrobianos para una limpieza y conformación adecuadas, creando un ambiente libre de microorganismos al erradicar tantos como sea posible del espacio del conducto radicular. Aunque es un irrigante de oro estándar, el hipoclorito de sodio (NaOCl) es conocido por sus efectos citotóxicos en los tejidos periapicales vitales, lo que hace que sus concentraciones más altas sean inapropiadas para su uso en condiciones como ápices amplios, subdesarrollados o dañados y en casos de perforaciones. En consecuencia, si se determina que una forma en gel de hipoclorito de sodio tiene una actividad antibacteriana equivalente a la forma de solución acuosa, podría emplearse en tales situaciones. El objetivo de este estudio fue la evaluación microbiológica del gel de hipoclorito de sodio al 5.25% y la solución acuosa como desinfectantes del conducto radicular en dientes multirradiculares con lesiones endodónticas primarias. Tras la aprobación ética y el registro en el CTRI, se consideraron 42 pacientes que dieron su consentimiento y tenían dientes multirradiculares con necrosis pulpar y periodontitis apical asintomática para el estudio. Después de abrir el acceso, realizar una reconstrucción pre-endodóntica en caso de cavidades de clase II y determinar la longitud de trabajo, se adquirió una muestra preoperatoria (S1), que se consideró la carga microbiana preoperatoria de ese conducto, del conducto más grande utilizando un punto de papel estéril mientras se mantenía una estricta aislamiento y desinfección. Se utilizó un enfoque de aleatorización por computadora para dividir los dientes en dos grupos al azar justo antes de comenzar la preparación quimio-mecánica: Grupo A (n = 21) - desinfección del conducto con gel de hipoclorito de sodio al 5.25%; Grupo B (n = 21) - desinfección del conducto con solución acuosa de hipoclorito de sodio al 5.25%. Tras la desinfección del conducto, se recogió una muestra postoperatoria (S2), que se consideró la carga microbiana postoperatoria de ese conducto, del mismo conducto utilizando un punto de papel estéril. Las Unidades Formadoras de Colonias (UFC) para las muestras S1 y S2 se determinaron después de 48 h de incubación aeróbica en placas de agar Brain Heart Infusion (BHI). Los pacientes y el microbiólogo fueron cegados durante todo el procedimiento. Utilizando el software SPSS 20.0 (EE. UU.), se utilizaron la prueba de Shapiro-Wilk y la Corrección de Significancia de Lilliefors para la normalidad, seguida de la prueba U de Mann-Whitney que se utilizó para comparar la diferencia de UFC (x10) entre los dos grupos. Un valor de