El cambio climático tiene un impacto en la producción agrícola, incluida la mayor persistencia de los patógenos de las plantas en el medio ambiente. Por lo tanto, surge la pregunta de cómo proteger de manera efectiva y segura las plantas utilizando productos químicos, cuyo número disminuye cada año. El objetivo de este estudio fue evaluar el efecto fungistático de 2-acetiltiofenetiossemicarbazona (2actpTS) y cis-jasmonetiossemicarbazona (JTS) contra (Fc) en plántulas de trigo de invierno. Se investigó la influencia de las tiossemicarbazonas (TSs) en el estado de salud y la fitotoxicidad de las plántulas y la actividad biológica del suelo. Antes de la aplicación de TSs (riego o pulverización), el suelo estaba infectado con (cepa n.º 37). El tipo de sustancia y el método de aplicación influyeron significativamente solo en el peso fresco de las plántulas. La fitotoxicidad variable de las moléculas dependía principalmente de su método de aplicación a las plantas. La fitotoxicidad más alta de las plántulas se registró cuando los compuestos se aplicaron durante el riego y la más baja cuando se pulverizaron. Los resultados mostraron que la aplicación de las sustancias 2actpTS y JTS, tanto en forma de riego como de pulverización, tuvo un efecto positivo en el estado de salud de las plantas, expresado por el valor del índice de enfermedad (DI). La presencia del agente infeccioso y el tipo de compuesto químico aumentaron la actividad enzimática del suelo. El mayor número total de bacterias se encontró en el suelo infectado con Fc y en las muestras de suelo donde se aplicó JTS mediante riego y pulverización. La mayor utilización de aminas, amidas y aminoácidos por los microorganismos se encontró en las muestras donde se aplicó JTS. Los resultados obtenidos se utilizarán para crear productos intermedios para la protección de los cereales contra las enfermedades de Fusarium, no solo en la etapa de germinación y labranza de las plantas, sino también en etapas de desarrollo posteriores.