Llevamos a cabo la caracterización multivariada de la variabilidad fenotípica en 27 tratamientos que eran combinaciones de cultivos de cobertura, método de labranza y año. Se empleó el análisis de variante canónica para observar nueve rasgos microbiológicos en un experimento establecido en un diseño de parcelas divididas. Entre 2011-2013, se llevó a cabo un experimento de campo en suelos clasificados como . El primer factor de orden fue el análisis del efecto de la siembra de un cultivo de cobertura de rastrojo: (Control: Sin siembra de cultivo de cobertura; cultivo de cobertura sembrado después de desbroce; sin labranza: Cultivo de cobertura sembrado directamente). El segundo factor experimental implicó evaluar los efectos de tres métodos de labranza (siembra directa; labranza simplificada a una profundidad de 12-15 cm con un cultivador combinado; arado de primavera a una profundidad de 25 cm) en nueve rasgos microbiológicos. El año de investigación se utilizó como factor para diferenciar entre el recuento y la actividad de los microorganismos del suelo. Los rasgos (mohos y bacterias copiotróficas, y bacterias oligotróficas y actinobacterias) estaban significativamente correlacionados (positiva o negativamente) en los cinco términos. La prueba de Pearson confirmó las relaciones entre los grupos fisiológicos de microorganismos del suelo después de la aplicación de materia orgánica, y capturó la correlación positiva entre mohos y copiotrofos en todos los términos del estudio.