Las precipitaciones, especialmente en climas continentales con tendencia monzónica, afectan a los nichos microbianos durante el cultivo de ginseng de montaña. Con cambios en la comunidad microbiana, las enfermedades en el ginseng cultivado y protegido bajo condiciones de refugio de lluvia pueden verse alteradas. Tal cultivo puede influir en la dinámica de la microflora a través de variaciones en los parámetros meteorológicos; sin embargo, esto aún no está claro. El presente estudio encontró que el cultivo bajo refugio de lluvia afectó la distribución de las comunidades fúngicas dentro del ginseng de montaña cultivado. Esto llevó a una mejor estructura de la comunidad en la rizosfera del ginseng, caracterizada por la proliferación de hongos antagonistas y una reducción de hongos patógenos. Un análisis de correlación de factores meteorológicos encontró que la temperatura del suelo y la humedad fueron los principales factores meteorológicos que afectaron al ginseng de montaña cultivado. Es evidente que el cultivo bajo refugio de lluvia reguló el ambiente microecológico de la rizosfera del ginseng de montaña y resultó en resultados positivos. Una investigación de enfermedades respaldó este hallazgo. La incidencia de enfermedades de la raíz del ginseng, como el óxido y la pudrición de la raíz, se redujo en un 5-6%. La incidencia de enfermedades de las hojas del ginseng, incluido el moho gris y las manchas negras, se redujo en un 5-10%. Esta investigación proporciona evidencia para abordar la dinámica de la ecología microbiana bajo el cultivo bajo refugio de lluvia y sus beneficios para la gestión sostenible del ginseng de montaña cultivado.