Los estudios sobre la calidad del aire interior (CAI) han relacionado la exposición a microorganismos en el aire interior con una variedad de enfermedades. La asociación entre la calidad del aire interior, la contaminación de superficies y la CAI bajo procedimientos de limpieza heterogéneos son factores cruciales que se investigaron en este estudio. La prueba de bioluminiscencia de ATP demostró una correlación significativa (r = 0.89; 0.05) con el recuento bacteriano obtenido de muestras de hisopos y una correlación moderada (r = 0.57; 0.001) con el recuento de bacterias viables en sedimentación. Para toda la muestra (pre y post limpieza), los valores de ATP fueron heterogéneos, promediando 230 RLU/100 cm, 140 RLU/100 cm, 120 RLU/100 cm, 135 RLU/100 cm, 99 RLU/100 cm y 80 RLU/100 cm, en oficinas, aulas, pomos de puertas de baños, escritorios de recepción, vestíbulos principales y pomos de puertas de salida, respectivamente. Una asociación insignificante entre PM2.5 interior y exterior (r = 0.21; 0.05), una relación I/O de PM2.5 con un valor promedio de 1.2, y una relación I/O de CO que supera 1 sugieren un impacto menor del aire exterior. Después de la limpieza, los recuentos bacterianos y fúngicos en las superficies interiores mostraron una reducción significativa, lo que sugiere que los procedimientos de limpieza fueron efectivos. Las concentraciones de COV pero no de HCHO en el aire interior se vieron significativamente afectadas por la limpieza, pero no por la temperatura o la humedad relativa (HR). Proponemos la bioluminiscencia de ATP como un sustituto para detectar la contaminación bacteriana en lugar de la contaminación fúngica, que requiere una validación adicional. Sugerimos que los resultados del muestreo microbiano activo (en UFC/m) y de placas de sedimentación (en UFC/m/h) se interpreten de manera independiente para evitar confusiones.