En este estudio, investigamos las variaciones en el rendimiento de producción, el estado de salud y la microbiota intestinal de conejos de carne criados en un establo semiconfinado durante el verano y el invierno. En comparación con el verano, los conejos criados en invierno tenían un peso de sacrificio y un peso de canal significativamente mayores. Los conejos alimentados en verano eran más vulnerables a diferentes estresores, lo que llevó a un aumento en los niveles de proteínas de HSP90, IL-1alpha, IL-1beta, IL-2 y concentraciones de MDA, pero disminuyó las actividades de GSH y SOD. Además, se observaron diferencias significativas en las comunidades microbianas intestinales. En comparación con el invierno, los conejos alimentados en verano tenían una diversidad alfa y beta significativamente más baja y más alta. Tanto Firmicutes como Verrucomicrobiota fueron los filos dominantes, y representaron mayores proporciones en invierno que en verano. A niveles más bajos de taxones microbianos, se identificaron varios microbios estacionalmente enriquecidos de manera diferencial, como , el , el , , y Muribaculaceae. Las capacidades funcionales vinculadas a la proliferación microbiana, el metabolismo de nutrientes y las respuestas adaptativas ambientales mostraron abundancias significativamente diferentes entre el verano y el invierno. Además, se presentaron fuertes interacciones entre diferentes indicadores. Basándonos en nuestros hallazgos, no solo propusimos varias estrategias potenciales para mejorar los efectos indeseables de los cambios estacionales en la productividad y la salud de los conejos de carne, sino que también subrayamos las direcciones para futuros estudios mecanicistas de la fisiología de adaptación.