El conejo europeo es considerado una plaga agrícola en la isla de Lemnos, Grecia. En las últimas tres décadas, su población en la isla ha crecido rápidamente, lo que ha resultado en importantes interrupciones ecológicas y pérdidas económicas. Para obtener una comprensión más clara de su distribución y preferencias de hábitat, realizamos encuestas de campo en toda la isla y utilizamos técnicas de análisis espacial para identificar áreas de alta densidad (puntos críticos) y los factores ambientales que impulsan su presencia. Nuestros hallazgos revelaron que los conejos están altamente concentrados en llanuras fértiles de baja altitud, particularmente en áreas con campos cultivados y abandonados. Notablemente, más de la mitad de las áreas de alta densidad se superpusieron con zonas de conservación, y las preferencias de hábitat fueron fuertemente influenciadas por factores que apoyan la construcción de madrigueras, proporcionan refugio y aseguran abundantes recursos alimenticios. El modelado espacial reveló además que las condiciones del hábitat en una área afectan significativamente las densidades de conejos en regiones vecinas, enfatizando la naturaleza interconectada de sus poblaciones. Nuestros hallazgos proporcionan información esencial para guiar estrategias de gestión específicas que puedan equilibrar las necesidades agrícolas con las prioridades de conservación en entornos insulares.